De março de 2020 a janeiro de 2021 foram coletadas 250 amostras em Manaus e outros 24 municípios . A análise destas detectou a existência de 18 linhagens diferentes do Sars-CoV-2 no estado do Amazonas.
O Instituto Leônidas & Maria Deane (ILMD/Fiocruz Amazônia) e a Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas, divulgaram nota técnica conjunta informando que a variante P.1, vulgo “variante do Amazonas”, foi encontrada em 32 das 35 amostras (91,4%) colhidas durante o mês de janeiro. O número é bastante maior que em dezembro, onde 28 das 55 amostras (51%) possuiam a variante P.1. Em novembro, esta variante não foi encontrada.